simple\_scvi.MyPyroModel
========================

.. currentmodule:: simple_scvi

.. add toctree option to make autodoc generate the pages

.. autoclass:: MyPyroModel



Attributes table
~~~~~~~~~~~~~~~~~~

.. autosummary::

    ~simple_scvi.MyPyroModel.adata
    ~simple_scvi.MyPyroModel.adata_manager
    ~simple_scvi.MyPyroModel.device
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_normalized_function_name
    ~simple_scvi.MyPyroModel.history
    ~simple_scvi.MyPyroModel.is_trained
    ~simple_scvi.MyPyroModel.registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.summary_string
    ~simple_scvi.MyPyroModel.test_indices
    ~simple_scvi.MyPyroModel.train_indices
    ~simple_scvi.MyPyroModel.validation_indices





Methods table
~~~~~~~~~~~~~

.. autosummary::

    ~simple_scvi.MyPyroModel.convert_legacy_save
    ~simple_scvi.MyPyroModel.data_registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.deregister_manager
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_anndata_manager
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_from_registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_latent
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_normalized_expression
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_setup_arg
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_state_registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.get_var_names
    ~simple_scvi.MyPyroModel.load
    ~simple_scvi.MyPyroModel.load_registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.register_manager
    ~simple_scvi.MyPyroModel.save
    ~simple_scvi.MyPyroModel.setup_anndata
    ~simple_scvi.MyPyroModel.to_device
    ~simple_scvi.MyPyroModel.train
    ~simple_scvi.MyPyroModel.transfer_fields
    ~simple_scvi.MyPyroModel.update_setup_method_args
    ~simple_scvi.MyPyroModel.view_anndata_setup
    ~simple_scvi.MyPyroModel.view_registry
    ~simple_scvi.MyPyroModel.view_setup_args
    ~simple_scvi.MyPyroModel.view_setup_method_args





Attributes
~~~~~~~~~~~



adata
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.adata

adata_manager
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.adata_manager

device
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.device

get_normalized_function_name
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.get_normalized_function_name

history
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.history

is_trained
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.is_trained

registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.registry

summary_string
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.summary_string

test_indices
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.test_indices

train_indices
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.train_indices

validation_indices
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. autoattribute:: MyPyroModel.validation_indices






Methods
~~~~~~~



convert_legacy_save
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.convert_legacy_save

data_registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.data_registry

deregister_manager
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.deregister_manager

get_anndata_manager
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_anndata_manager

get_from_registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_from_registry

get_latent
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_latent

get_normalized_expression
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_normalized_expression

get_setup_arg
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_setup_arg

get_state_registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_state_registry

get_var_names
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.get_var_names

load
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.load

load_registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.load_registry

register_manager
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.register_manager

save
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.save

setup_anndata
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.setup_anndata

to_device
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.to_device

train
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.train

transfer_fields
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.transfer_fields

update_setup_method_args
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.update_setup_method_args

view_anndata_setup
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.view_anndata_setup

view_registry
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.view_registry

view_setup_args
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.view_setup_args

view_setup_method_args
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^

.. automethod:: MyPyroModel.view_setup_method_args